Bueno ya lo he sacado, posteo el codigo por si alguien le sirve de algo.
Antes de todo hay que activar el scheduler en la consola de mysql o en el panel de admin.
SET GLOBAL event_scheduler = ON;
CREATE EVENT `delete_user`
ON SCHEDULE EVERY 1 DAY
STARTS CURRENT_TIMESTAMP
DO DELETE FROM micocina_usuarios WHERE DATE_ADD(date_register, INTERVAL 3 DAY) >NOW() and activated=0;
Bueno este evento se dispara cada dia, empieza el día que se creo con current_timestamp ,elimina el usuario si el campo date_register han pasado tres dias y este no esta activado (activated=0);